Transmisi rumah tangga dari virus korona manusia endemik di AS

Dalam studi terbaru yang diterbitkan dalam Journal of Infectious Diseases, para peneliti melakukan studi transmisi rumah tangga besar untuk menggambarkan hasil klinis infeksi endemik human coronavirus (hCoV) dan risiko kemungkinan transmisi tingkat rumah tangga dan komunitas di Allegheny County, Pennsylvania, di Amerika Serikat (AS).

Studi: Dinamika Penularan Virus Corona Manusia Musiman di Rumah Tangga. Kredit Gambar: MariaSbytova/Shutterstock.com

Latar belakang

Para peneliti menggambarkan dan secara kuantitatif menandai tingkat serangan CoV berdasarkan usia, frekuensi gejala, dan probabilitas penularan CoV di komunitas dan rumah tangga.

Untuk melakukannya, mereka menggunakan model rantai-binomial dalam kerangka Bayesian yang mengoreksi data yang hilang dari rumah tangga yang belum diuji.

HCoV endemik menyebabkan penyakit pernapasan, rata-rata, setidaknya sekali pada anak di bawah lima tahun. Keempat strain hCoV, HCoV-229E, HCoV-HKU1, HCoV-OC43, dan HCoV-NL63, akan menginfeksi orang saat dewasa. Studi serologi dan virologi telah menunjukkan bahwa mereka menginfeksi kembali orang sepanjang hidup mereka.

Studi pelacakan kontak sebelumnya telah menunjukkan bahwa kontak serumah berisiko lebih tinggi untuk tertular sindrom pernapasan akut coronavirus 2 (SARS-CoV-2) daripada rekan non-rumah tangga mereka.

Karena evolusi berkelanjutan dari SARS-CoV-2 dan kekebalan tingkat populasi yang meluas dari infeksi dan vaksinasi, pengawasan individu tanpa gejala menjadi semakin penting untuk memahami transmisi rumah tangga SARS-CoV-2.

Dalam hal ini, memahami epidemiologi HCoV endemik, karakterisasinya dengan studi transmisi rumah tangga, dan perbandingannya dengan epidemiologi SARS-CoV-2 dapat membantu mengetahui transmisi dan perubahan faktor risiko untuk perubahan SARS-CoV-2 sebagai penyakit coronavirus 2019 ( COVID-19) pandemi berlangsung.

Selanjutnya, ini dapat membantu mengidentifikasi patogen endemik lain yang dapat menginfeksi manusia.

Tentang penelitian

Dalam studi ini, peneliti menggunakan data dari studi berbasis sekolah, Surveillance Monitoring of Absenteeism and Respiratory Transmission (SMART). Studi ini dilakukan di antara anak-anak sekolah berusia lima hingga 19 tahun dan anggota rumah tangga mereka di Allegheny County, Pennsylvania, untuk memperkirakan kemungkinan penularan infeksi hCoV yang dikonfirmasi dengan reaksi berantai transkriptase polimerase (RT-PCR) terbalik dari individu yang terinfeksi. ke kontak rumah tangga.

Populasi penelitian mengalami 121 infeksi hCoV musiman yang dikonfirmasi RT-PCR, dinilai dengan pengawasan penyakit mingguan selama dua musim virus pernapasan, Desember 2015–April 2016 dan Januari 2017–Mei 2017.

Tim secara prospektif menindaklanjuti dengan 164 dan 163 rumah tangga untuk penyakit mirip influenza (ILI) masing-masing selama 22 dan 16 minggu pada tahun pertama dan kedua. Secara keseluruhan, mereka merekrut dan menindaklanjuti 947 individu dari 223 rumah tangga.

Selanjutnya, para peneliti mengirimkan kit swab hidung yang dapat dikelola sendiri ke semua rumah tangga yang melaporkan kejadian ILI. Kemudian, mereka menguji sampel swab ini menggunakan panel RT-PCR multipleks untuk mengidentifikasi sampel yang positif HCoV pernapasan.

Model studi mengasumsikan hanya satu generasi transmisi dalam rumah tangga per minggu rumah tangga, yang berarti tidak ada kasus indeks. Juga, ini bekerja dengan asumsi bahwa individu yang terinfeksi dengan satu HCoV menularkan strain tersebut ke individu rentan lainnya di dalam rumah. Kemudian, mereka memaksimalkan jumlah keempat log-likelihood khusus strain.

Studi ini berfokus terutama pada empat hCoV, yaitu, HCoV-229E, HcoV-HKU1, HcoV-NL63, dan HcoV-OC43, dan lima kelompok umur, anak-anak kurang dari lima tahun, anak-anak antara lima hingga sembilan tahun, remaja berusia 10 hingga 19 tahun, dewasa berusia 20 hingga 49 tahun, dan dewasa ≥50 tahun.

Tim melaporkan proporsi infeksi HCoV berdasarkan karakteristik demografis dan klinis serta variabel kontinyu dan kategoris sebagai median dan persentase (%), masing-masing, dan tingkat serangan sekunder rumah tangga (SAR) untuk rumah tangga dengan setidaknya satu kasus HCoV.

Mereka menghitung SAR sebagai infeksi HCoV dikurangi satu dibagi ukuran rumah tangga dikurangi satu. Mereka juga melaporkan interval kepercayaan 95% (CI) binomial yang tepat untuk proporsi.

Hasil

Para penulis mencatat bahwa penularan di antara anggota rumah tangga menyumbang 21% dari semua infeksi HCoV, dan sebagian besar infeksi terjadi karena subtipe HCoV-OC43. Namun, tidak seperti penelitian sebelumnya, penulis mengamati tidak ada perbedaan akuisisi masyarakat antara orang dewasa dan anak-anak.

Dibandingkan dengan orang dewasa yang terinfeksi hCoV, proporsi anak-anak yang lebih tinggi (<19 tahun) mengembangkan gejala ILI (risiko relatif 3, 95% CI), ditandai dengan demam dan batuk/sakit tenggorokan, dan probabilitas penularan komunitas mingguan adalah 7%. Meskipun penularan rumah tangga kemungkinan besar terjadi dari individu bergejala dan tanpa gejala, individu tanpa gejala berkontribusi 20% hingga 40% dari penularan rumah tangga endemik CoV di berbagai model.

Semua anak, terutama anak yang lebih muda, lebih sering mengalami infeksi simtomatik, menunjukkan bahwa mereka memiliki kekebalan yang lebih rendah daripada individu yang lebih tua yang melaporkan lebih sedikit gejala dan proporsi infeksi asimtomatik yang lebih tinggi.

Biasanya orang dewasa rentan terhadap infeksi hCoV, tetapi memiliki kekebalan tertentu. Namun, probabilitas penularan komunitas atau rumah tangga tidak bervariasi berdasarkan usia atau status gejala. Selanjutnya, simulasi menunjukkan bahwa penelitian ini kurang bertenaga untuk mendeteksi perbedaan tersebut.

Kesimpulan

Studi ini menggabungkan surveilans simtomatik dengan swabbing rumah tangga untuk menangkap infeksi simtomatik dan asimtomatik dan mempelajari kontribusi relatif masing-masing terhadap penularan rumah tangga dari hCoV endemik yang umum.

Namun, studi dengan kumpulan sampel yang lebih besar dijamin untuk mendapatkan hasil yang kuat tentang variasi terkait transmisibilitas berdasarkan karakteristik individu.

Meskipun demikian, penelitian tersebut memberikan wawasan yang sangat dibutuhkan tentang tingkat penularan rumah tangga dan faktor-faktor yang terkait dengan SAR di rumah tangga untuk menginformasikan rancangan penelitian untuk penularan rumah tangga SARS-CoV-2.